早期胚胎功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)獲揭示
近日,北京大學(xué)第三醫(yī)院?jiǎn)探、閆麗盈課題組有關(guān)早期胚胎發(fā)育機(jī)制方面的研究成果,在線發(fā)表在《自然·通訊》上。
胚胎在卵裂期發(fā)生合子基因組激活(ZGA),不斷分裂、分化,形成具有內(nèi)細(xì)胞團(tuán)(ICM)和滋養(yǎng)外胚層(TE)細(xì)胞的囊胚。這一過(guò)程中發(fā)生了劇烈的轉(zhuǎn)錄和表觀遺傳變化。研究團(tuán)隊(duì)前期完成了對(duì)配子及早期胚胎各發(fā)育時(shí)期轉(zhuǎn)錄組、甲基化組等圖譜的繪制。在此基礎(chǔ)上,團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一種單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù),可同時(shí)對(duì)單個(gè)細(xì)胞的RNA表達(dá)、DNA甲基化、染色質(zhì)可及性進(jìn)行分析。團(tuán)隊(duì)利用這一技術(shù),首次對(duì)哺乳動(dòng)物植入前胚胎在單細(xì)胞分辨率上多個(gè)層面的調(diào)控關(guān)系進(jìn)行了全面聯(lián)合分析。
該研究發(fā)現(xiàn),利用胚胎中單細(xì)胞DNA甲基化信息的特征,可實(shí)現(xiàn)對(duì)從合子到八細(xì)胞發(fā)育階段的每個(gè)卵裂球進(jìn)行遺傳譜系重建分析;在植入前胚胎發(fā)育過(guò)程中,母本基因組高甲基化區(qū)域主要富集在基因區(qū)域,而父本基因組高甲基化區(qū)域主要富集在遠(yuǎn)端的基因間區(qū)。同時(shí),發(fā)現(xiàn)了一系列可能參與調(diào)節(jié)ZGA過(guò)程的順式作用元件,確定了參與調(diào)節(jié)囊胚ICM/TE特異性轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的順式作用元件。(仰東萍)
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