結(jié)直腸腺瘤癌變基因圖譜繪出
近日,北京大學第三醫(yī)院付衛(wèi)研究團隊與北京大學湯富酬研究團隊聯(lián)合在國際知名學術(shù)期刊《腸道》上在線發(fā)表論文,深入探究了結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展過程,揭示了腺瘤發(fā)生和癌變過程中的重要基因突變和轉(zhuǎn)錄組變化特征,為結(jié)直腸癌預防、早期篩查和治療提供了新的線索和思路。
據(jù)了解,結(jié)直腸癌是全球范圍內(nèi)發(fā)病率第三、致死人數(shù)第四的惡性腫瘤,結(jié)直腸腺瘤是結(jié)直腸癌的癌前病變,從低級別腺瘤發(fā)展為腺癌需要10年以上時間。因此,深入解析低級別腺瘤向腺癌轉(zhuǎn)化的生物學機制對于結(jié)直腸癌防治有重要意義。
家族性腺瘤性息肉病(FAP)是由APC抑癌基因胚系突變導致的常染色體顯性遺傳的結(jié)直腸腺瘤綜合征,表現(xiàn)為大腸腸腔內(nèi)布滿大小不一的腺瘤樣息肉,息肉至少在100枚以上。如不及時在腸鏡下切除息肉或者手術(shù)切除相應腸管,息肉癌變率高達90%以上。FAP患者手術(shù)切除標本中有大量處于不同演進階段的結(jié)直腸腫瘤性病變,這非常有助于闡明結(jié)直腸腺瘤的癌變過程。
研究人員對7名FAP患者的手術(shù)切除標本進行了全基因組淺測序和全外顯子組深度測序,深入研究了同一個體中不同腫瘤間的譜系發(fā)生關(guān)系及腺瘤癌變過程中的基因組變異情況。同時,對7名FAP患者及2名散發(fā)性結(jié)直腸癌患者手術(shù)切除標本中的8757個細胞進行了高精度單細胞轉(zhuǎn)錄組測序,構(gòu)建了腺瘤癌變過程的轉(zhuǎn)錄組圖譜,系統(tǒng)闡述了該過程中基因表達變化的重要特征。
該研究發(fā)現(xiàn),肉眼可見的腺瘤已處于癌變過程后期,對腺瘤的積極處理和密切隨訪意義重大。出現(xiàn)頻率最高的體細胞致病突變是抑癌基因APC基因的二次失活突變,不同個體在其他致病基因突變譜上表現(xiàn)出強烈的個體間異質(zhì)性。FAP標本大腸上皮中存在區(qū)域癌變現(xiàn)象,此發(fā)現(xiàn)對于進一步理解結(jié)直腸多發(fā)腺瘤的發(fā)生機制和臨床治療具有重要指導意義。與非FAP標本相比,在基因表達上FAP標本的癌旁上皮細胞已經(jīng)表現(xiàn)出明顯的癌變傾向,此發(fā)現(xiàn)進一步證實了對APC胚系突變攜帶人群進行密切隨訪的重要意義。
該研究還揭示了腺瘤發(fā)生和癌變過程中基因表達變化的關(guān)鍵特征,部分解釋了腫瘤細胞中糖酵解增強現(xiàn)象,同時表明三羧酸循環(huán)和丙酮酸代謝水平的降低是腫瘤發(fā)生過程中的最早期事件之一,可能是FAP腺瘤預防和治療的潛在靶點。(特約記者仰東萍 通訊員周鑫)
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