劉紅星:腫瘤本質上是基因病 基因測序重在對序列的解讀
人民網北京5月31日電 (曾璇) 血液腫瘤是威脅人類健康與生存的惡性腫瘤,世界衛(wèi)生組織2016年版造血和淋巴組織腫瘤分類標準中,一共列出187個單獨的分類。多年來,中國常見惡性腫瘤的統(tǒng)計排名中,急性白血病與淋巴瘤一般處于第八位至第十位,并且發(fā)病呈現年輕化趨勢。
診斷是實現惡性血液腫瘤精準治療的前提,只有準確診斷并精確了解每一例腫瘤發(fā)生和發(fā)展的生物學規(guī)律,才能對患者施以最佳的治療。近年來基因測序的臨床應用使血液腫瘤的診治趨于精準化,某些基因如激酶類突變、轉錄因子突變、表觀遺傳類突變的存在不但可以幫助確定治療方案,還可預測藥物療效。人民網近日邀請到了北京陸道培血液病研究院副院長、陸道培醫(yī)院病理和檢驗醫(yī)學科主任劉紅星,他為網友揭示了基因序列中蘊含著哪些神奇的“生命密碼”,以及基因測序在血液腫瘤診斷和治療中的應用。
血液腫瘤要充分了解病患細節(jié) 施以最精細的個體化治療
醫(yī)學上對血液腫瘤的分類是一個不斷精細化的過程,也就是說分類越來越細、種類越來越多。
劉紅星介紹,世界衛(wèi)生組織2016年的造血和淋巴組織腫瘤分類標準,結合病理、形態(tài)、流式、染色體、基因等多種檢測,將急性髓系白血病分列了23個主要分型。其中一個顯著趨勢是:直接根據基因異常進行分類命名的血液腫瘤越來越多,除了可以直接命名外,具有預后和靶向治療意義的基因異常指標也越來越多。血液腫瘤還有骨髓增生異常綜合征、慢性髓系腫瘤、急性和慢性淋巴細胞白血病、淋巴瘤以及系列不清的白血病等,在上述分類標準中一共列出了187個單獨的分類。
他同時指出,即便把血液腫瘤分成187種不同的疾病類別,也不是分為同一類的病人診療情況都完全一樣。比如AML-ETO融合基因陽性的急性髓性白血病被列為單獨的分類,這部分患者大多數可以通過化療治愈。但如果男性患者的腫瘤細胞有AML-ETO融合基因的同時又丟失了Y染色體,就幾乎不可能通過化療治愈。對于這部分患者,就應該在化療控制住腫瘤細胞后,盡早進行造血干細胞移植治療。還有的患者除了AML-ETO融合基因,還同時有KIT基因突變,也會變得更加難治,甚至出現化療根本控制不住腫瘤細胞的情況。對于這部分患者,可以加用對KIT基因突變有效的靶向藥達沙替尼或伊馬替尼等,與化療藥物一起將腫瘤細胞控制下來。但這部分患者如果不進行造血干細胞移植治療的話,仍然容易復發(fā)。因此對于這些患者,針對KIT基因突變的靶向治療的意義不在于治愈或長期維持緩解,而是幫助患者獲得短期的病情控制,以獲得進行造血干細胞移植治療的機會。
“因此在臨床診療過程中,既要對患者的疾病按診斷指南進行分類,又不能只拘泥于分類,這才是真正的實施精準醫(yī)療和個體化醫(yī)療。只診斷為白血病是不夠精確的,甚至把白血病分為幾十上百種腫瘤來認識本質上也是不夠精確的。只有充分了解了該患者疾病的具體特征,才能對患者施以最精細的、效果最好的個體化治療!眲⒓t星說。
基因檢測不僅幫助診斷和鑒別 還可幫助選擇最佳化療方案和藥物
劉紅星表示,現在已經公認腫瘤本質上是基因病,基因變異是腫瘤發(fā)生的根本和直接原因。血液腫瘤也不例外,每一個血液腫瘤的發(fā)生都是有多種基因異常共同作用的結果。某些異常讓腫瘤細胞異常的大量增殖,如JAK2 V617F基因突變;有些異常讓增殖的腫瘤細胞的發(fā)育停滯在幼稚階段,如IKZF1基因突變;還有的異常幫助腫瘤細胞逃避體內免疫細胞的監(jiān)視,如HLA基因缺失。所以每一個腫瘤的發(fā)生,都可以說是由多種基因突變分工協作的“犯罪團伙”在一起作案。
“基因檢測可以幫助確定這個‘犯罪團伙’中每個成員的身份,以及分工和藏匿的地方?梢詭椭袛嗍遣皇茄耗[瘤以及是哪種血液腫瘤,對腫瘤性質進行判斷。還可以根據基因突變的特點選擇最有效的治療方案(包括靶向藥和有效的化療藥等),對其施以精確的打擊。近年來遺傳藥物基因組學也越來越被重視,以前用藥時主要根據標準劑量或者按體重、體表面積計算用藥的劑量。但我們知道不同人的飯量可以有顯著差異,飯量大小也不總是和體重、體表面積成比例。用藥也是如此,越來越多的研究明確藥物代謝酶等基因的遺傳多態(tài)性對很多藥物在體內的代謝速度和毒副作用有顯著影響。因此同樣按照標準劑量用藥,有的患者會因代謝過快導致劑量不足,而有的患者還會因代謝過慢導致實際上過量和毒副作用。而藥物基因組學檢測可以幫助患者更精確地實現個體化用藥!彼忉。
基因檢測臨床應用的意義是多方面的,隨著醫(yī)學研究的進展,在血液腫瘤中具有明確臨床意義的基因指標越來越多,也就有越來越多的基因需要被檢測。有些基因異?雌饋碇皇且粭l基因的問題,但實際情況復雜!叭鏚MT2A異位的融合基因,實際上已經報道的就有與100多種不同伙伴基因的融合形式;可導致伴先天骨髓衰竭和端粒異常的髓系腫瘤的的遺傳突變基因有100多種;WT1基因的異常,既有可能是基因和蛋白序列發(fā)生了突變,也有可能是表達量異常增高或與其他基因形成融合基因!眲⒓t星舉例。
血液病檢驗領域發(fā)展并不平衡 第三方獨立醫(yī)學實驗室模式值得推廣
雖然近年來越來越多的檢測指標具有臨床應用價值,但血液病檢驗領域的發(fā)展仍然存在桎梏。
作為從事臨床醫(yī)師工作3年、血液病基因檢測和研究工作15年、同時負責陸道培醫(yī)院病理和檢驗醫(yī)學科科室建設和行政管理工作的專業(yè)人士,劉紅星認為,國內血液病檢驗應用普及方面的地域發(fā)展不均衡現象嚴重。由于很多綜合醫(yī)院的血液科相對較小、病人量少,很多檢查雖然有明確的臨床意義,但由于標本量不足以支撐開展、人員培訓困難、儀器設備昂貴等因素,大多數醫(yī)院難以系統(tǒng)開展血液病特殊檢測項目。比如世界衛(wèi)生組織從2008年版血液腫瘤分類標準開始就將CEBPA基因突變的白血病單獨分類,并且雙CEBPA基因突變的患者容易通過化療治愈。但至今很多醫(yī)院的實驗室仍不能開展CEBPA基因突變檢測,臨床醫(yī)生也就沒條件依據這些十年前就有了的診斷標準對患者進行診斷和治療。一方面患者不能獲益于已有的醫(yī)學知識,另一方面醫(yī)生也難以有深刻的體驗和認識,甚至會帶來不信任和懷疑的態(tài)度,這也不利于知識和應用的推廣。
他認為,近年來國家越來越倡導和支持第三方獨立醫(yī)學實驗室模式,這有利于血液病特殊檢驗項目和具有類似特點的其他醫(yī)學檢驗項目的推廣應用。區(qū)域中心式的第三方獨立醫(yī)學實驗室可以實現標本和服務集約化、集中和更高效率利用資源、減少總醫(yī)療開支。未來血液病理和檢驗醫(yī)學的發(fā)展,或將是各級醫(yī)院逐漸開展部分實施起來相對簡單、標本量相對較多的項目,同時存在一些綜合的、區(qū)域中心式的檢驗服務機構提供項目更多、更綜合的檢測服務。
“以陸道培醫(yī)療集團為例,作為血液病專科醫(yī)療和研究機構,集團的病理和檢驗醫(yī)學團隊現有160多人專注于血液病檢驗。團隊成員分工協作,從病理、形態(tài)、流式、染色體、基因、臨床藥理、微生物鑒定等多方面提供專業(yè)、準確的實驗室檢測指標,以幫助臨床醫(yī)生對患者病情進行盡量全面和精確評價,以及精準的治療。目前,團隊所開項目的臨床意義和報告質量得到業(yè)內普遍認可,國內有一百多家三甲醫(yī)院常規(guī)送標本到這里來做檢測。我們也體驗到以中心實驗室的形式提供醫(yī)學檢驗服務,可以幫助更多醫(yī)生和醫(yī)院的醫(yī)療水平得以提升,讓更多患者獲益于最新的醫(yī)學研究成果,同時醫(yī)院也避免了經濟效益不佳的投入和不同醫(yī)院間的重復建設!眲⒓t星說。
基因測序服務的核心不在“測序” 而在對序列的解讀
隨著醫(yī)學研究的飛速發(fā)展,基因檢測將在越來越多的疾病診療過程中發(fā)揮重要作用,甚至在未病階段的疾病個體化預防、選擇最適合的鍛煉方式等方面都會有很大應用空間。當前基因檢測大多還標價昂貴,但正處于迅速降價和普及的階段。在未來,對全基因組/全外顯子組測序的應用或將迎來很好的預期。
事實上,基因檢測的應用服務似乎已經開始在我們的身邊顯現:只需一滴唾液就可以知道自己有何運動天賦、只需一點口腔黏膜就可以知道自己身上有哪些民族的影子……像這樣的基因檢測真實性和科學性有多少呢?劉紅星表示,祖源分析、解酒基因類的檢測服務都有科學依據,雖然這些項目初看起來似乎更多是娛樂的意義,但他們也都有各自被需求的情況。隨著更有意義的項目越來越多和收費的減低,直接面向大眾的基因檢測服務會越來越多幫助大家從生物學意義上更清晰地了解和認識自己:比如我為什么酒量低?為什么我運動方面耐力更好、但爆發(fā)力差?等等。這甚至會帶來一些觀念的沖擊,但一旦有條件做到,對自身的特質多一些了解總體還是益處多于顧慮,會是必然的發(fā)展方向。
劉紅星指出,我們需要改變的一個觀點是:很快基因測序服務的核心不在于“測序”本身,而在于對序列的解讀。他舉了一個生動的例子說明:“這就好像書籍最大的價值不在于印刷,而在于閱讀和理解。基因測序也是如此,拿到一份全基因組序列,只相當于拿到了一套關于某一個人的人體百科全書。人類基因組中有兩萬多個基因,每一個基因的功能都不同;蚪M序列也就像有兩萬多個章節(jié)的百科全書,雖然其中記載著很多和生命活動相關的信息,但每個章節(jié)的內容可能迥異。因此對其中某一本、某一章節(jié)、某一段文字,都需要不同專業(yè)的人來解讀才靠譜。我們查閱百科全書時,常常是去查找特定的一個或幾個問題的答案。我們面對基因組信息時也是如此,想一次性解讀或理解基因組序列里的全部信息是不現實的,也不會被實際需求!
劉紅星最后補充說:“基因檢測還可用于某些疾病的風險預測和預防。前幾年明星朱莉因發(fā)現遺傳有BRCA1基因突變采取了預防性手術切除乳腺以避免患乳腺癌的例子倍受爭議。但預防干預的方式并不總是這么殘忍和難以接受。比如現在已經發(fā)現,二甲雙胍對遺傳有FANCA基因突變而容易患再生障礙性貧血和白血病的人有延緩再障和減少白血病發(fā)生的作用,這樣的預防措施就比前面的手術容易接受的多。我們的研究院近期正在立項研究維生素C對TET2突變的血液腫瘤的治療作用,和在已經有TET2突變但還沒有血液腫瘤臨床表現的老年人群中的預防作用。如果可以通過合適的方式應用維生素C就可以減少或阻止部分血液腫瘤的發(fā)生,將是非常有意義的事情。隨著醫(yī)學研究的進展,諸如此類可以通過溫和和安全的方式給予預防的情況會越來越多!
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